Dib u eegista MDJ ee Sanadka: "Deep Genotyping" - Waa maxay taxanaha jiilka saddexaad na bari karaa

Cinwaanka maqaalku waa, Sahaminta Cudurada Neurogenerative Isticmaalka Isku xigxiga Akhriska Dheer iyo Tiknoolajiyada Khariidaynta Genome. Labadiinaba waan idiinku hambalyeynayaa magacaabista muhiimka ah. Dr. Cogan, wax yar nooga sheeg taariikhdaada iyo waxa kugu dhiirigeliyay inaad qorto warqadan

Dr. Guillaume Cogan: Hi. Waad ku mahadsan tahay inaad na haysato. Waxaan ahay hidde-yaqaan caafimaad oo hadda [00:01:00] Waxaan shahaadada PhD ka qaadanayaa Machadka Maskaxda ee Paris. Waxaanan mashruuc ka wada yeelanay machadka maskaxda ee Paris oo ay la socdaan machadyada caafimaadka qaranka, asxaabteena sidoo kale wada qorayaasha warqada, Kensuke Daida, Cornelis Blauwendraat, iyo Kimberly Billingsley.

Markaa asal ahaan waxaanu haysanay koox ah kiisaska PD ee aan la xalin, kuwaas oo lahaa isku xigxiga dhiiga. Oo waxaan helnay kiisas qoys iyo sidoo kale kiisas bilawga hore ah waxaana rabnay inaan isku dayno inaan aqoonsanno wax la mid ah isbeddelka keena cudurka. Si aan sidaas u yeelno, waxaan isticmaalnay taxane akhris dheer. Wixii faah faahin ah ee ku saabsan arrintaas ayaan geli doonaa mustaqbalka. Oo waxaan helnay kiis xiiso leh, waxaan rabnay inaan tan u soo sheegno cilladaha dhaqdhaqaaqa, sidaas darteed waan sameynay. Tifaftiruhu wuxuu naga codsaday inaan dib u eegis ku samayno isku xigxiga akhrinta dheer, laakiin sidoo kale khariidaynta genome-ka indhaha si loo helo dib-u-eegis tignoolajiyada cusub ee tignoolajiyada cusub ee aan u isticmaali karno xanuunada neurodegenerative.

Dr. Sarah Camargos: Aad u fiican. Waxaan u maleynayaa genetics, waxay mararka qaarkood dareemi kartaa mawduuc adag [00:02:00] dhakhaatiirta neerfaha. Haddaba aan dib u qaadno oo aan ku bilowno aasaaska. Waxaan dooneynaa inaan ka hadalno noocyada kala duwanaansho ee keena cudurrada neurodegenerative, kala duwanaanshaha nucleotide hal, kala duwanaanshaha qaabdhismeedka, iyo soo celinta ballaarinta.

Fadlan ma sharxi kartaa farsamooyinkan loo isticmaalo in lagu barto noocyadan kala duwanaanshiyaha.

Prof. Alexis Brice: Haa, waan bilaabi karaa oo Guillaume wuu dhamaystirmi doonaa. Waxaan u maleynayaa in waxa runtii muhiim ah ay tahay xaqiiqda ah in akhriska dheer ee isku xigxiga ay ka dhigan tahay in aad falanqeyn karto jajabyada dheer ee DNA-da halkii aad ka heli lahayd wax la mid ah 150 ilaa 300 oo lammaane ah oo loo akhriyo jajab kasta waxaad haysataa wax la mid ah tobanaan kilo oo saldhig ah, tanina wax badan ayaa isbeddelaya.

Sababtoo ah waxaad ogaan kartaa wax badan oo ka mid ah [00:03:00] dib u habeyn, kuwaas oo aan lagu ogaan farsamooyinka caadiga ah. Waxayna tani ka dhigan tahay, tusaale ahaan, marka uu jiro rogan ku yimaadda hidda-wadaha waxaad arki kartaa meelaha la isku xidho. Waad u kala dambayn kartaa. Waxaad si fudud u ogaan kartaa nuqul ka mid ah ama tirtiridda.

Taasina waa mowduuc sidoo kale loogu talagalay cudurro badan oo neurodegenerative ah. Iyo sidoo kale ku celi balaadhinta. Kuwa yaryar waxaa lagu qabsan karaa farsamooyinka qadiimiga ah, laakiin marka ay dhaafaan xajmiga 300 ee lammaanaha aasaasiga ah, ma awoodaan. Sidaas oo ay la socoto akhris dheer. Mar labaad, waxaad soo qaadan kartaa noocyada kala duwanaanshiyaha.

Markaa taasi waa dhinacyada ugu muhiimsan. Laakiin waxaa jira kuwo kale. Waxaad tusaale ahaan kala saari kartaa shakhsiyaadka leh laba nooc oo hiddo-wadaha. Waxaad sheegi kartaa inay ku jiraan cis ama inay ku jiraan trans. Iyo cudurka recessive, [00:04:00] waa inay ku jiraan trans haddii aad rabto inaad hubiso inay iyagu masuul ka yihiin cudurka.

Waxa kale oo aad heli kartaa codsiyo hiddo-wadaha iyo pseudogenes marka ay yihiin kuwo isku mid ah oo isku xigxiga dheer ee akhrisku u ogolaanaya mar kale in ay isku xigxigaan si madax banaan hidda-socodka. Markaa taasi runtii waa aasaaska waxaana hubaal ah inaan ku siin karno dhawr tusaale haddii aad rabto.

Dr. Sarah Camargos: Aad u fiican. Gaar ahaan markaan akhriyay warqadaada, waxaan aad u xiiseeyay inaad isticmaasho tusaalooyinkan si aad u muujiso faa'iidooyinka akhriska dheer ee taxanaha sida aad sheegtay pseudogenes iyo wejiga. Fadlan ma nala wadaagi kartaa sheekada ku saabsan walaalaha iyo mataanaha ee leh noocyada PRKN? 

Dr. Guillaume Cogan: Haa Markaa saaxiibkeen ka socda NIH, Kensuke Daida, ayaa markii ugu horreysay lahaa labadan walaalo leh nooc phenotype ah oo la socon kara cudurka Parkinsons. [00:05:00] Markaa walaaluhu waxay lahaayeen bilaw hore, cudurka tartiib tartiib tartiib tartiib tartiib tartiib tartiib tartiib tartiib tartiib tartiib tartiib tartiib tartiib tartiib tartiib ah. Markaa akhris gaaban oo taxane ah.

Waxay haysteen hal nooc oo nucleotide ah laakiin hal nooc oo keliya, sidaa darteed kuma filna in la sharaxo cudurka. Kadibna waxay adeegsadaan taxane akhrin dheer waxayna ogaadeen rogaal celis ku jira alxanka labaad, kaas oo sharaxaya cudurka. Dulqaadkuna aad buu u weynaa. Waa todoba mega base.

Sidaas awgeed, waxay sharraxaysaa sababta aysan u helin marka hore. Ka dibna kooxdayada. Waxa kale oo aanu haysanay laba walaalo ah oo qaba qaabka autosomal recessive ee cudurka oo la jaan qaadaya PRKN, mar labaad, oo leh phenotype. Oo waxaan markii hore isticmaalnay hababka isku xigxiga ee caadiga ah xoojinta baaritaanka ligation-ka badan, isku xigxiga la beegsanayo oo leh taxane exome.

Oo waxaan helnay tirtirka exome four, laakiin kaliya hal bedel ayaa mar kale, si taasi kuma filna in la sharaxo cudurka. Waxaan isticmaalnay, mar kale, akhrin dheer oo taxane ah, waxaanan helnay wax aad u xiiso badan. Markaa daraasaddii ugu horreysay waxaan [00:06:00] ka saarnay exome three iyo exome four, tan labaadna waxaan ku darnay nuqul ka mid ah exome three.

Markaa guud ahaan waxaan haynaa laba koobi oo ah exome three, taas oo caadi ah, sax? Waxaan rajeynayaa inaan dhammaanteen ku haysanno laba koobi oo exome three halkan.

Waxaan rajeynayaa oo tani waa sababta qalabka kale ee isku xigxiga ay u awoodi waayeen inay arkaan taas. Oo kaliya, aynu nidhaahno akhrinta dheer ee taxanaha ah ayaa aqoonsan kara tan.

Ka dibna Kensuke iyo asxaabtiisuba waxay kordhiyeen daraasaddan, waxaan u maleynayaa inay ahayd 23 shaqsi oo leh hal nooc oo PRKN ah iyo bilawga hore ee PD, waxayna awoodeen inay xalliyaan rubuc ka mid ah kiisaska iyagoo isticmaalaya isku xigxiga akhris dheer. Markaa tani waa wax macno leh, waxaan filayaa. Dhakhaatiirta neerfayaasha ayaa ka fekeri kara marka ay qabaan bukaan leh hal isbeddel oo ku jira PRKN iyo phenotype oo ku habboon.

Dr. Sarah Camargos: Oo waxaa lagugu hanuuniyay oo kaliya in aad wax ka qorto. Tani waa mid aad u xiiso badan. Markaa adigu, wax yar qoday si aad u aragto haddii uu jiro kala duwanaansho qaabdhismeed kaas oo sharxi kara kan kale ee trans [00:07:00] kala duwanaanshaha.

Taasi sax ma tahay? 

Dr. Guillaume Cogan: Haa.

Dr. Sarah Camargos: Cajiib. Marka laga soo tago helitaanka hiddo-wadaha cusub, arrin kale oo xiiso leh oo la sahaminayo ayaa ah muujinta ballaarinta soo noqnoqda.

Sidee bay sifadani ugu habboon tahay fahamka phenotype ama la-talinta hidde-raaca?

Prof. Alexis Brice: Waxaan u maleynayaa inay jiraan ugu yaraan laba dhinac oo ballaarinta soo noqnoqda ah. Marka hore waa cabbirka iyo cabbirka ku habboon ayaa aad muhiim u ah sababtoo ah inta badan waxaa jira marin ka sarreeya kaas oo soo noqnoqda la odhan karo waa cudur-sidaha. Waxayna tani aad u kala duwan tahay marka loo eego cilladaha. Iyo qaar ka mid ah, waa inaan sheego in marinka laga yaabo inuu qiimo lahaado wali waa lagu muransan yahay, laakiin ugu yaraan qiimo gaar ah, waxaad hubtaa inay tahay cudur-sidaha.

Markaa kan ugu horreeya waa cabbirka, kaas oo gabi ahaanba [00:08:00] muhiim u ah ogaanshaha. Dhinaca labaadna waa isku xigxiga soo noqnoqda. Sababtoo ah waxay soo baxday in qaar ka mid ah loci aysan ahayn kaliya cabbirka, laakiin sidoo kale ka kooban yahay soo noqnoqda, taas oo muhiim ah. Waxaana jira noocyo kale oo ka kooban, kuwaas oo qaar ka mid ah ay yihiin cudur-sidaha iyo kuwa kale oo si fiican loogu dulqaadanayo oo aan la xiriirin cudurka.

Isku xigxiga akhriska dheer, waxaad ku helaysaa labadaba hal dhagax. Waxaad leedahay labadaba cabbirka soo noqnoqda iyo halabuurka, sidaas darteed waxaad sheegi kartaa in soo noqnoqda ay tahay cudur-sidaha iyo in kale. Waxayna tani aad muhiim ugu tahay qaar badan oo ka mid ah kuwa dhowaan la aqoonsaday sida FGF 14 ama RFC 1 tusaale ahaan.

Dr. Guillaume Cogan: Haa, waxaa laga yaabaa inaan tusaalooyin ka bixiyo. FGF 14 waa tusaale aad u wanaagsan. Markaa iyadaa ka mas'uul ah [00:09:00] spinocerebellar ataxia nambarka 27 B ayaa dhawaan la aqoonsaday waxaana ognahay in fidinta GAA ee ka hooseeya 200, aysan ahayn cudur-sidaha. Si kastaba ha ahaatee, marka soo noqnoqda ay ka sarreyso 300, waxaan ognahay in ay tahay cudur-sidaha oo isticmaalaya isku xigxiga akhrinta gaaban sababtoo ah cabbirka jajabku waa akhrinta qiyaastii 150.

Ma ogaan karno wax ka dheer. Waxaan dhihi karnaa waxaa jira balaadhin ka sarreeya 150, laakiin ma sheegi karno inay ka sarreeyaan 300 iyo in kale. Markaa ma odhan karno haddii ay tahay cudur-sidaha oo aynu u baahanahay tignoolajiyad kale si aynu u nidhaahno. Laakin iyadoo la adeegsanayo isku xigxiga akhrinta dheer, waxaan u sheegi karnaa si sax ah cabbirka ballaarinta waxaanan dhihi karnaa haddii balaadhinta ay ka sarreyso heerka iyo haddii kale.

Tusaale kale oo muhiim u ah motif-ku waa hidde-side ka mas'uul ah cillad-yaqaanka caanka ah ee cerebellar ataxia neuropathy vestibular areflexia syndrome, sidaas darteed CANVAS. Oo waxaan ognahay balaadhinta dheer ee [00:10:00] AAAG, markaa waa shan nucleotide. Ma aha cudur-sidaha. Si kastaba ha ahaatee, balaadhinta motif AAGGG waa cudur-sidaha oo isticmaalaya isku xigxiga akhrinta dheer, waxaanu leenahay ujeeddada si aan u ogaan karno inay tahay cudur-sidaha iyo in kale.

Oo waxaan u maleynayaa in wax sidoo kale muhiim ah ay tahay joogitaanka ama maqnaanshaha carqaladeynta. Taasna waxaan kaga hadlaynaa warqadda. Markaa waxaan u maleynayaa tusaale wanaagsan waa spino cerebellar ataxia two. Markaa waa balaadhinta CAG. Oo haddii ballaarintan CAG, waxaan leenahay hakad ama hakadyo dhowr ah CAA halkii CAG, waxaan ognahay inaysan mas'uul ka ahayn ataxia spinocerebellar laakiin cudurka Parkinson.

Ujeedadu waa joogitaanka ama maqnaanshaha isdhexgalka waa muhiim. Wixii phenotype ah, laakiin sidoo kale da'da bilawga ah, galitaanka, dhaxalka cudurka iyo darnaanta iyo nooca phenotype. 

Prof. Alexis Brice: Markaa waxaan xaqiiqdii filan karnaa inaan [00:11:00] aqoonsanno in badan oo soo noqnoqonaya mustaqbalka. Waxaan ognahay in xanuunada neerfaha ay si gaar ah u badan yihiin.

Markaa waxaan u malaynayaa, innagoo isku taxluujinaya kiisas kale oo badan, waxaan xaqiiqdii ogaan doonnaa isbeddellada aan la garanayn mustaqbalka.

Dr. Sarah Camargos: Oo weliba waxaad awooday inaad hubiso methylation-ka. Waxaad wax yar ka fahmi kartaa muujinta hiddaha.

Dr. Guillaume Cogan: Gebi ahaanba adeegsiga hababka ugu muhiimsan ee isku xigxiga akhrinta dheer. Waxaan aqoonsan karnaa methylation-ka, tanina waxay leedahay dabcan, saameyno dhowr ah oo ku saabsan cudurrada sababtoo ah badanaa mar walba maahan kiiska. Laakiin inta badan walxaha hypermethylated ee DNA-da ayaa leh hadal yar marka loo eego hypomethylation.

Iyo macnaha guud ee xanuunka neurodegenerative. Waxaan filayaa in tani ay tahay mid xiiso leh. Tusaale ahaan, haddii aan leenahay hidda-socodka. Kaliya tan wax ku bartay NOTCH2NLC, oo mas'uul ka ah marka [00:12:00] aad leedahay GGGC, ballaarinta shanta agabka hore. Waxay mas'uul ka tahay cudur la yiraahdo Neuronal Intranuclear Hyaline Inclusion Disease, oo waxay ogaadeen inay aad u xiiso badan tahay, waalidiinta aan waxyeello u geysan carruurta uu saameeyay cudurkaan waxay lahaayeen ballaarin dheer marka loo eego faraca. Markaa lama filayo, sax? Laakin iyaga oo isticmaalaya isku xigxiga akhrinta dheer, waxay ogaadeen in fidinta GGC-da ee waaliddiinta ay tahay hypermethylated. Markaa hiddasidaha ayaa si yar loo muujiyay marka loo eego ballaarinta hoose. Balaadhintani waa cudur-sidaha sababta oo ah waxay u horseedaysaa RNA 4 C taas oo horseedda kala-soocidda borotiinnada isku xidha RNA.

Markaa asal ahaan haddii aad dareen hoose leedahay, waxa kaa yar RNA 4C ka dibna ma qabtid cudurka. Aad bay u xiiso badan tahay in la arko in methylation ay noo ogolaato inaan fahamno sababta isbeddellada qaarkood aysan u ahayn cudur-sidaha marka la barbardhigo kuwa kale.

Dr. Sarah Camargos: Cajiib. Aad u xiiso badan. [00:13:00] Aan wax yar ka hadalno, annagoo beegsanayna taxanaha akhriska dheer. Bishii Abriil, 2024, waxaanu waraysi la yeelanay Prof. Houlden iyo Dr. Zhongbo Chen anagoo adeegsanayna taxane akhris dheer oo la beegsaday si aan u sharaxno SCA4. Ma na xasuusin kartaa habkani sida uu u shaqeeyo iyo haddii uu jiro hab kale oo lagu beegsanayo halkii wax walba la isku xigsiin lahaa.

Dr. Guillaume Cogan: Haa. Markaa waa su'aal wanaagsan sababtoo ah waxaad isticmaali kartaa taxanaha akhriska dheer ee dhowr dhinac. Markaa waxaad samayn kartaa isku xigxiga guud ee genome-ka laakiin waxaad sidoo kale samayn kartaa isku xigxig la beegsaday. Oo waxaan dhihi lahaa waxaa jira, warqadda waxaan kaga hadlaynaa saddex hab oo tan loo sameeyo. Markaa marka hore waxaad isticmaali kartaa habka Cas9.

Markaa waxaad kaliya ku qabsanaysaa gobolka xiisaha adoo isticmaalaya CRISPR Cas9, ka dibna waxaad isku xigsiinaysaa kaliya gobolkan xiisaha. Markaa tani waa tii ugu horreysay. Mid kale ayaa isna ah mid fudud. Waa PCR-dheer. Markaa waxaad kor u qaadaysaa gobolkaaga xiisaha adoo isticmaalaya dhererka PCR-ga dheer [00:14:00]. Laakiin dabcan haddii aad tan isticmaasho, waxaad yeelan kartaa eexda xoojinta sababtoo ah waxaad isticmaashaa falcelinta silsiladda polymerase, sax?

 Markaa kani waa kii labaad, kan ugu dambeeyana waxa bixiya Oxford Nanopore Technologies. Markaa kan ugu dambeeya waa muunad la-qabsi ah oo aad u xiiso badan.

Markaa asal ahaan waxaad haysataa xargaha DNA-gaaga, kaas oo mara daloolka. Oo daloolku wuxuu falanqeyn doonaa 100-kii ugu horreeyay lammaane salka. Tusaale ahaan, 400 oo lammaane saldhig ah, oo waxay arki doontaa haddii lammaanahan salku ay ku jiraan gobolka xiisaha ee aad u sheegtay mashiinka isku xigxiga inay isku xigxigaan. Markaa haddii ay aragto in jajabkani aanu ahayn mid dano leh, waxay ka saartaa jajabka.

Markaa waxay isku xigsiin doontaa oo kaliya ilaa iyo iyada oo loo marayo jajabyada daloolka xiisaha leh. Markaa waa saddexda hab. Cas9 ku salaysan, PCR dheer, iyo muunad la qabsiga ONT.

Dr. Sarah Camargos: Aad u fiican. Borofisar Brice, waxaan ogaaday in isku xigxiga akhriska dheer uu la mid yahay nooca hidaha [00:15:00] ee phenotyping qoto dheer, nooca genotyping qoto dheer. Ma ku raacsan tahay?

Prof. Alexis Brice: Waxaan si buuxda ugu raacsanahay, iyada oo la adeegsanayo phenotyping qoto dheer, waxaad helaysaa waxyaabo aadan arkin sababtoo ah uma aadan raadin si sax ah. Oo waxaan u maleynayaa inay taasi runtii muhiim u tahay dhakhaatiirta neerfayaasha si ay u awoodaan inay sameeyaan phenotyping qoto dheer, taas oo caawin karta ogaanshaha. Oo halkan waa isku mid sababtoo ah qalabyada aan isticmaalnay ilaa inta la akhriyay taxanaha dheer ma aysan awoodin inay ogaadaan qaar ka mid ah noocyadan.

Oo hadda oo aan haysanno qalabkan, waxaan soo qaadan karnaa noocyadan waxaanan hagaajin karnaa ogaanshaha. Markaa run ahaantii waa isku mid marka laga reebo in qiimaha phenotyping qoto dheer laga yaabo inuu ka yaraado isku xigxiga akhriska dheer xilligan, ugu yaraan.

Dr. Sarah Camargos: Haa Isagoo ka hadlaya caqabadaha marka ay timaado akhrinta dheer ee isku xigxiga maxay yihiin [00:16:00] caqabadaha waaweyn ee innaga ah? Qiimaha ka sokow.

Dr. Guillaume Cogan: Marka laga reebo kharashka caqabadaha waa marka hore, shaybaarka qoyan. Markaa borotokoolka shaybaadhka qoyan weli lama jaanqaadin. Sidoo kale, dhuumaha bioinformatic si loogu yeero kala duwanaanshiyaha ma aha mid heersare ah. Iyo sidoo kale waxaad u baahan tahay awood badan oo kaydinta xogta sababtoo ah waxay soo saartaa boqolaal saldhigyo giga ah.

Markaa waxaad u baahan tahay awood kaydineed oo wanaagsan. Sidoo kale GPU-yada wanaagsan iyo CPU-yada si loogu yeero kala duwanaanshuhu waa xisaabin aad u adag oo dhamaadka silsiladda, aan nidhaahno inaan fasirno kala duwanaanshiyaha, sidoo kale way adagtahay sababtoo ah waxaan haynaa kala duwanaansho badan. Ugu yaraan waxaan ku kalsoonahay kala duwanaanshiyahayaga sababtoo ah, tusaale ahaan, haddii aad sameyso taxane akhris gaaban, waxaad isku daydaa inaad falanqeyso kala duwanaanshaha qaabdhismeedka, waxaad ogtahay in qaar badan oo iyaga ka mid ah ay yihiin kuwo been abuur ah. Laakin adigoo isticmaalaya isku xigxiga akhrinta dheer, waxaad ogtahay in intooda badani ay yihiin kuwo run ah. Si kastaba ha noqotee, marka aan falanqeyno kala duwanaanshaha, haddii aad rabto inaad ogaato sababta cudurka bukaanka, waxaad dooneysaa inaad meesha ka saarto kala duwanaanshaha leh [00:17:00] inta jeer ee caadiga ah, dhammaanteen xaq u leh inaan dooranno kala duwanaansho.

Shayga ayaa ah in muddo dheer oo isku xigxig ah, aanan haysanin buug-gacmeedyo sida Genome 80 oo loogu talagalay taxanaha akhrinta gaaban. Markaa way adagtahay in la shaandheeyo kala duwanaanshaha akhriska gaaban. Si kastaba ha ahaatee, waxaa jira qaar ka mid ah mashaariicda iskaashiga ah, tusaale ahaan, mashruuca 1000 Genome kaas oo iskuxiran boqolaal haddii aysan ahayn kumanaan kontaroolo caafimaad leh si ay noo siiyaan xogta dadweynaha, taas oo noo ogolaanaysa inaan muujino kala duwanaansho iyadoo loo eegayo inta jeer.

Iyo, ugu dambeyntii, isagoo xoogaa khibrad u leh, mararka qaarkood waa niyad jab sababtoo ah waxaad tahay sida, waxaan isku daraa dhammaan noocyada kala duwanaansho ee aan haysto sida kala duwanaansho qaabdhismeedka SNDs, akhrin gaaban oo soo noqnoqonaya, laakiin ma helayo isbeddellada hidde-socodka. Laakiin waan ogahay inay halkan taallo meel, laakiin kaliya, waxaan soo qaadan karaa malaha hal tusaale.

Tusaale ahaan, waxaanu ku haynaa kala duwanaansho qaab dhismeedka gudaha ah oo saamayn kara kala goynta hidda-wadaha, laakiin ma hayno wax qalab ah oo aanu ku saadaalino haddii ay saamaynayso kala goynta iyo in kale. Markaa waxaan rajaynaynaa in mustaqbalka bioinformaticians [00:18:00] ay horumarin doonaan aaladahaas si aan ugu dambeyntii u aqoonsan karno sababta cudurka dhammaan dadka qaba cillad hidde-side, aynu niraahno.

Dr. Sarah Camargos: Ama xitaa isku xigxigay dhammaan RNA sidoo kale.

Dr. Brice ama Cogan: Haa, tani waa mid kale. Isticmaalka isku xigxiga dheer. Haa, waxaan aqoonsan karnaa isoforms cusub marka aan ka hadlayno warqadda.

Dr. Sarah Camargos: Sidoo kale warqadaada waxaad ku sahamisay suurtagalnimada khariidaynta genome-ga indhaha. Noo sharax sida farsamadani u shaqeyso iyo maxay yihiin faa'iidooyinka ugu muhiimsan.

Dr. Guillaume Cogan: Markaa way ka duwan tahay marka la barbar dhigo isku xigxiga akhrinta dheer sababtoo ah ma aha taxane. Markaa asal ahaan waxa aad DNA-gaaga ku calaamadisaa qaar ka mid ah taxanaha canonical, taxane gaagaaban, ka dibna waxa aad haysataa mikroskoob oo eegaya masaafada u dhaxaysa summadaada DNA-da ee summadaysan. Markaa taas waxaad ku garan kartaa kala duwanaanshiyaha qaab-dhismeed ee ka sarreeya 500 oo lammaane sal ah.

Markaa wax intaas ka hooseeya ma arki kartid. Taasi waa hal shay. Adiga [00:19:00] sidoo kale ma arki kartid SND-yada, kala duwanaanshaha nucleotide kaliya iyadoo la adeegsanayo khariidaynta genome-ga. Si kastaba ha ahaatee, aad ayay u xiiso badan tahay sababtoo ah qoto dheer, daboolka ayaa ka wanaagsan marka la barbardhigo akhrinta dheer ee isku xigxiga. Waxaad heli kartaa 150 qoto dheer oo dabool ah adigoo isticmaalaya OGM marka la barbar dhigo inta badan 20 ilaa 30 x oo leh taxane akhris dheer.

Iyo, iyo haa, taasi waa waxa ugu weyn ee OGM waxaan dhihi lahaa. Markaa dadka qaarkiis waxay isbarbardhigeen OGM iyo taxanaha akhris dheer. Iyo isku xigxiga akhriska dheer, way adagtahay in la aqoonsado kala duwanaanshiyaha, kala duwanaanshaha qaabdhismeedka kuwaas oo ka sarreeya 50 kb. Si kastaba ha ahaatee, OGM way wanaagsan tahay in la aqoonsado nooca isbeddelladaas. Markaa waxaan dhihi lahaa haddii aad lacag haysato, waad isticmaali kartaa labadaba taasina waxay noqon lahayd tan ugu fiican.

Laakiin waxaad u baahan tahay lacag aad ku sameyso 

Dr. Sarah Camargos: Dabcan.

Prof. Alexis Brice: Maya, waxaan ula jeedaa, waxaad sidoo kale u baahan tahay DNA-da culeyska unugyadu sareeyo taasina mararka qaarkood waa xaddid farsamooyinkan. Iyo bangiyada biobanking ee qadiimiga ah waxay mararka qaarkood isticmaalaan farsamooyinka soo saarista [00:20:00] kuwaas oo aan bixinaynin DNA-gaas. Markaa waa shay ay tahay inaad ku xisaabtanto ugu yaraan, koox-kooxeedyada ama muunadaha mustaqbalka ee aad qaadanayso.

Dr. Guillaume Cogan: Haa Waxba sidoo kale OGM, waxaan u maleynayaa xaddidaadda OGM ee u wanaagsan in la ogaado dhageystayaasha ay tahay inay aad u adag tahay in la helo goobta saxda ah ee dhibcaha nasashada iyadoo la adeegsanayo OGM. Caadi ahaan ma heli kartid. Waxay u dhaxaysaa 6 KB ilaa 15kb. Marka waxay noqon kartaa mid muhiim u ah hidaha caafimaadka sababtoo ah adigoo isticmaalaya OGM, waxaad dhihi kartaa kala duwanaansho qaabdhismeedku wuxuu ka kooban yahay exome, halka aysan sidaas ahayn maahan been-abuur been ah, laakiin maahan sida saxda ah kala duwanaanshaha qaabdhismeedka ilaa inta la akhriyo taxanaha.

Marka mar labaad, way fiican tahay inaad isticmaasho labadaba haddii aad rabto inaad isticmaasho OGM, haa.

Dr. Sarah Camargos: Markaa waxaad saadaalisay in labadan teknoolajiyada ay noqon doonaan ama noqon doonaan habka sanadka ugu horreeya ee lagu ogaanayo cilladaha neurogenerative ee la iska dhaxlo mustaqbalka? 

Prof. Alexis Brice: Waase haddii [00:21:00] lacagtu ay jirto in iyaga lagu bixiyo. Haa, waxaan u maleynayaa in, ay si cad u ogol yihiin in la xalliyo qayb ka badan kiisaska sidaas darteedna aad bay waxtar u leeyihiin. Waxaan u maleynayaa haddii aan rabno in aan helno hab loo wajaho habka koowaad iyo kan ugu dambeeya halkaasoo hal tignoolajiyada ay bixin karto natiijooyinka.

Dr. Guillaume Cogan: Haa, weli waxaa jirta waddo dheer oo loo maro si loo helo tignoolajiyadan marka hore halkan, waxaan dhihi lahaa. Haa.

Dr. Sarah Camargos: Haa. Aad u fiican. Kahor intaanan dhammayn ma jirtaa hal fariin oo muhiim ah oo aad labadiinuba jeclaan lahaydeen in dhegaystayaasheena ay ka qaataan warqaddan?

Dr. Guillaume Cogan: Haa. Markaa waxaan u maleynayaa inaad u baahan tahay inaad ogaato mashruucaaga iyo runtii waxaad rabto inaad aragto ka hor intaadan isticmaalin tignoolajiyadan. Oo waxaan filayaa in maqaalkeena, waxaan isku daynay intii karaankeena ah inaan bixinno tusaalooyin si uu akhristuhu u fahmo waxa uu ka heli karo tiknoolajiyadan. Oo waxaan u malaynayaa haa, akhrinta maqaalkani waa hab si fiican loo fahmo tan oo u isticmaal [00:22:00] hab ku habboon mid kasta oo mashruuca qof ah. Haa.

Dr. Sarah Camargos: Haa Markaa dhakhaatiirta aad baad ugu mahadsan tihiin inaad nagu soo biirtaan. Oo la wadaag fikradahaaga maanta. Waad ku mahadsan tahay dhammaan dhegaystayaasheena sida aad noogula joogtaan Podcast-ka MDS. La soco qaybtayada xigta, ilaa iyo markaas ka taxadar oo nabad galyo.

Dr. Guillaume Cogan: Waad ku mahadsan tahay inaad na haysato.